Vous pensiez diriger votre vie grâce à votre volonté et vos aspirations personnelles ? Que nenni ! Les micro-organismes qui peuplent votre tube digestif vous influencent bien plus que vous ne le croyiez.
Il existe actuellement en France un projet de recherche ambitieux pour mieux comprendre les liens entre microbiote, santé et alimentation : le French Gut - le microbiote français.
Avant de vous parler plus en détail de ce projet unique, parlons du microbiote, et plus particulièrement du microbiote intestinal.
Le microbiote intestinal est l'ensemble des micro-organismes vivants (principalement des bactéries) qui peuplent nos intestins. Près de 50 000 milliards de bactéries vivent dans votre intestin.
Toutes ces bactéries sont très importantes :
En résumé, elles participent au bon fonctionnement de votre organisme.
Notre état de santé est influencé par l’état de santé de notre microbiote. Plus notre microbiote intestinal est riche et diversifié, meilleure est notre santé. Au contraire, un microbiote déséquilibré et appauvri pourrait favoriser l’apparition de maladies chroniques comme le diabète, l’obésité, certains cancers, ou encore la maladie d’Alzheimer. La façon dont nous mangeons impacte notre microbiote intestinal et notre santé. C’est pour cela que le French Gut a été lancé, pour mieux comprendre les liens entre microbiote, santé et alimentation.
Pour prendre soin de son microbiote intestinal avec l’alimentation, il faudrait d’une part apporter à votre organisme de « bonnes bactéries » pour l’enrichir, et d’autre part, bien nourrir ces « bonnes bactéries » pour stimuler leur développement.

On les retrouve dans les produits fermentés en général : les produits laitiers fermentés bien sûr (yaourts, certains fromages), mais aussi les végétaux fermentés (choucroute, légumes fermentés) ou des boissons fermentées (kéfir, kombucha). Ces produits fermentés agissent comme des probiotiques naturels.
On ne nourrit pas son microbiote avec des aliments ultra-transformés ! Ces aliments dénaturés ont en effet tendance à l’appauvrir car ils sont souvent pauvres en fibres et riches en additifs. Au contraire, on nourrit son microbiote avec de vrais aliments riches en fibres, c’est-à-dire : des fruits, des légumes, des légumineuses, des céréales complètes, des fruits secs, des fruits à coque, en résumé avec de vrais produits végétaux ! Et l’idéal serait de varier autant que possible ces vrais produits végétaux, car plus votre alimentation sera variée et « saine », plus votre microbiote sera diversifié et protecteur.
Les recherches sur le microbiote sont très prometteuses, mais pour mieux comprendre les liens entre microbiote intestinal, santé et alimentation, il faudrait pouvoir analyser de très nombreux microbiotes différents. Comment ? En analysant vos selles, votre caca ! Vos selles sont le reflet de votre microbiote intestinal et elles aident les scientifiques à mieux comprendre ces liens entre microbiote, santé et alimentation. Cela pourrait permettre à l’avenir de prévenir et soigner de nombreuses maladies chroniques telles que le diabète, l’obésité, ou certains types de cancers.
Aujourd’hui, pour faire avancer la science, « Le French Gut » a besoin de vous et cherche à collecter les selles de 100 000 volontaires. Vous avez bien compris, il s’agit de faire don de votre caca pour faire avancer la science ! Alors on compte sur vous, rendez-vous sur lefrenchgut.fr
Novembre 2025 : lancement du French Gut Kids !
Après le lancement en 2022 du projet Le French Gut, l’INRAE et ses partenaires lancent Le French Gut Kids pour explorer le microbiote intestinal des 3-17 ans. L’objectif ? Recueillir d’ici 2029 les échantillons fécaux de 10 000 enfants et adolescents, en bonne santé ou malades, sur tout le territoire français. L’étude vise à décrypter la diversité microbienne chez les plus jeunes, évaluer l’influence de l’alimentation, du mode de vie et de l’environnement familial, comprendre la transmission des bactéries de parent à enfant et les liens entre microbiote et pathologies fréquentes — allergies, asthme, troubles intestinaux. La démarche est participative et invite les familles à s’inscrire pour contribuer à bâtir la santé intestinale des générations futures.
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Vous pensiez diriger votre vie grâce à votre volonté et vos aspirations personnelles ? Que nenni ! Les micro-organismes qui peuplent votre tube digestif vous influencent bien plus que vous ne le croyiez.
Une équipe internationale impliquant l’INRAE a identifié une signature spécifique du microbiote intestinal dans la maladie de Parkinson. Ces résultats ouvrent la voie à un test de dépistage précoce et suggèrent que l’alimentation pourrait ralentir la progression de la maladie.
Les centenaires en bonne santé ont un microbiote intestinal similaire à celui de trentenaires également en bonne santé.