Il existe actuellement en France un projet de recherche ambitieux pour mieux comprendre les liens entre microbiote, santé et alimentation : le French Gut - le microbiote français.
Le Dr Steven Gundry est l'auteur du Code intestin, un livre qui s’appuie sur un fait énoncé par Hippocrate et aujourd’hui avéré : toutes les maladies commencent dans l’intestin. Selon Steven Gundry, toutes les maladies peuvent également être éliminées en prenant soin de l’intestin. Interview.
Dr Gundry : Le microbiome humain est composé de 100 000 milliards de cellules, de minuscules organismes vivant en nous. Ces bactéries se divisent, évoluent et échangent constamment des gènes, presque comme si elles exécutaient leurs propres mises à jour de logiciel biologique. Nombre d’entre nous pensent aujourd’hui qu’une grande partie de la « puissance de calcul » nécessaire au fonctionnement de notre corps a été externalisée vers notre microbiome.
C’est un peu comme le cloud computing. Tout comme nous utilisons désormais le cloud pour stocker et traiter d’énormes quantités de données, notre corps possède son propre « nuage bactérien » qui traite et stocke les informations pour nous. La plupart de ces opérations se déroulent à notre insu. Dans mon nouveau livre, je raconte comment ce nuage bactérien dirige discrètement une grande partie du processus. En fait, je soutiens qu’une part importante de nos comportements, bons comme mauvais, est influencée par notre microbiome intestinal.
Au lieu de se concentrer uniquement sur des analyses sanguines, nous pourrions nous tourner vers l’analyse d’échantillons de selles pour cartographier le microbiome et comprendre ce qui se passe réellement dans notre corps. La médecine personnalisée va dans ce sens.
Par exemple, dans mon livre, j’explique que les personnes anxieuses ont généralement un microbiome spécifique. Leur flore intestinale produit certaines substances chimiques – ou signaux, si vous préférez – qui contribuent à l’anxiété. Ce qui est fascinant, c’est que ce microbiome est manipulable. Chez les animaux, on peut modifier la flore intestinale et, surprise, l’anxiété s’améliore ou s’aggrave. Il en va de même pour la dépression : il existe un microbiome dépressif, et nous avons constaté qu’il peut lui aussi être modifié.
À la faculté de médecine, on m’a appris que le cerveau contrôlait essentiellement l’intestin, en grande partie grâce à ce gros nerf appelé le nerf vague, qui relie le cerveau à divers organes, dont l’intestin. L’idée était que le cerveau envoyait des instructions à l’intestin par ce nerf.
Mais il y a quelques années, nous avons découvert une chose surprenante : pour chaque fibre reliant le cerveau à l’intestin, neuf fibres remontent de l’intestin vers le cerveau. Cette découverte a véritablement ouvert une nouvelle compréhension de la communication entre l’intestin et le cerveau. Les scientifiques ont alors commencé à examiner les nerfs intestinaux et ont découvert une chose incroyable : il y a plus de neurones dans l’intestin – dans l’abdomen – que dans toute la moelle épinière. Cette découverte a donné naissance au concept d’axe intestin-cerveau.
Au départ, nous pensions que ces neurones intestinaux produisaient des composés importants comme la dopamine, la sérotonine et le GABA, qui ont un impact direct sur le cerveau et le sommeil. Mais grâce au Projet Microbiome Humain, nous avons découvert que ce n’étaient pas les neurones qui produisaient ces composés, mais les bactéries intestinales elles-mêmes.
L’idée principale de mon livre est de convaincre les gens qu’une grande partie de ce qui se passe dans notre cerveau – nos pensées, nos humeurs et même nos processus de réflexion quotidiens – est en réalité influencée par le microbiome intestinal, et pas seulement par le cerveau lui-même. De plus en plus de preuves le confirment.

Depuis des années, nous savons qu’il existe des bactéries obésogènes et des bactéries « maigres ». Les bactéries obésogènes, par exemple, peuvent littéralement prendre le contrôle de nos envies et nous pousser à rechercher les aliments qu’elles veulent que nous mangions.
À l’inverse, les bactéries « maigres » peuvent faire la même chose, mais de manière plus saine. Si nous leur donnons les composés dont elles se nourrissent, elles enverront des signaux à notre cerveau : « Tu n’as pas besoin de chercher plus de nourriture. Tout est OK. »
Le plus drôle, c’est qu’en tant qu’humains, nous aimons nous prendre pour des êtres super intelligents et avancés. Nous disons : « Oh, c’est ridicule ! Nous sommes les créatures les plus sophistiquées de la planète. L’idée que de minuscules organismes unicellulaires puissent influencer ce merveilleux temple du savoir est tout simplement absurde. » C’est pourtant le cas.
Les probiotiques sont ce qu’on appelle des « bonnes bactéries ». Mais voilà, la plupart d’entre eux ne sont pas natifs de notre intestin. Et la plupart d’entre eux ne survivent même pas à l’acidité gastrique. S’ils survivent, ils partent en vacances pendant quelques semaines. Ils se détendent, profitant en quelque sorte de la « plage » au fond de notre côlon. Et puis, ils repartent.
Ainsi, la plupart des probiotiques que vous prenez – s’ils survivent – devront être renouvelés assez régulièrement.
Le deuxième aspect concerne les conséquences. L’un des aspects les plus fascinants des probiotiques est lié aux postbiotiques, et l’un des exemples les plus célèbres est un probiotique appelé Akkermansia muciniphila.
Akkermansia est une bactérie qui adore le mucus. Ce qui est fascinant, c’est que cette bactérie est devenue en quelque sorte le Saint Graal des probiotiques pour une bonne santé. Ce qui est vraiment intéressant, c’est qu’on peut avaler de l’Akkermansia morte et obtenir quasiment le même effet que la version vivante. Et l’on pourrait se demander : « Mais bon sang ! Comment est-ce possible ? »
Eh bien, voilà : les bactéries peuvent « voir » et « penser ». Elles savent qui se trouve à proximité. Elles peuvent sentir quelles bactéries vivent à côté et lire le « code-barres » à la surface d’autres bactéries.
C’est un peu comme lorsqu’on passe le contrôle des passeports aujourd’hui, sans même avoir à montrer quoi que ce soit : on scanne juste son visage et l’ordinateur le reconnaît. Les bactéries font la même chose. Ainsi, lorsqu’une Akkermansia morte apparaît, les autres bactéries la reconnaissent. Elles disent : « Oh, Akkermansia est là. Super, on fait ceci ou cela. »
Donc, en fin de compte, ne vous inquiétez pas trop de savoir si vous prenez des bactéries vivantes ou mortes.

À l’origine, les postbiotiques étaient définis comme les produits de la fermentation bactérienne des prébiotiques. Nous avons ensuite découvert des composés comme les acides gras à chaîne courte – comme le butyrate, l’acide acétique (qui est du vinaigre) et l’acide propionique – qui sont également des postbiotiques. Ces composés servent d’outils de communication. Ils constituent littéralement le moyen par lequel les bactéries communiquent avec nos cellules et notre cerveau. C’est ce que nous appelons aujourd’hui les postbiotiques.
L’un des postbiotiques les plus importants est celui des acides gras à chaîne courte, comme le butyrate, aussi appelé acide butyrique. Plus on en apprend sur lui, plus on réalise son importance. Par exemple, la paroi de notre côlon a l’épaisseur d’une seule cellule. Cette fine barrière est tout ce qui nous sépare de tout ce que nous avalons, ainsi que des bactéries intestinales. Ce qui est fascinant, c’est que les cellules de cette paroi, appelées colonocytes, tirent environ 80 % de leur énergie du butyrate – non pas de l’oxygène, ni du flux sanguin, mais précisément du butyrate. Elles ont littéralement besoin d’absorber du butyrate pour se développer et fonctionner correctement.
Voici le point marquant. Si l’on y prête attention, on remarquera qu’une génération de personnes développe un cancer du côlon entre 30 et 40 ans. Et les recommandations de coloscopie sont de plus en plus précoces. Avant, c’était à 50 ans, puis à 45 ans, et maintenant, on commence à parler de coloscopies dès 40 ans.
Alors, que se passe-t-il ? Nous avons appris qu’en l’absence de butyrate, les cellules du côlon deviennent irritables, grincheuses et, plus ou moins, affamées. Dans ce cas, elles subissent des modifications dysplasiques, c’est-à-dire des transformations pouvant mener au cancer. Il existe une forte corrélation entre le manque de butyrate et ces modifications cancéreuses. À l’inverse, il existe également une forte corrélation entre le butyrate et la prévention du cancer du côlon.
Pour faire court, nous avons affaire à plusieurs générations qui ne produisent pas suffisamment de butyrate. Pourquoi ? Premièrement, nous manquons des bactéries responsables de sa production. Deuxièmement, nous ne leur fournissons pas la nourriture dont elles ont besoin pour prospérer et en produire.
On peut prendre tous les probiotiques du monde, mais si on ne leur donne pas ce dont ils ont besoin – si on ne leur fournit pas les précurseurs qu’ils utilisent pour les transformer en
d’autres composés – rien ne se passera.
Nous savons maintenant que les bactéries intestinales peuvent libérer de petits paquets d’informations – de minuscules fragments d’instructions génétiques – et les conditionner dans de petits conteneurs capables de traverser la paroi intestinale et même la barrière hémato-encéphalique.
Ces paquets sont appelés exosomes ou vésicules extracellulaires (VEC). Et croyez-le ou non, des sociétés scientifiques entières se consacrent à leur étude. Ces exosomes constituent une autre forme de communication – un langage – entre les bactéries de notre intestin et le reste de notre corps. Il s’agit d’un système complet de messagerie dont nous ignorions l’existence jusqu’à très récemment.
Les exosomes constituent une autre forme de communication entre les bactéries de notre intestin et le reste de notre corps
Oui. Nous avons un microbiome buccal et un microbiome nasal. Les femmes doivent savoir qu’elles ont un microbiome mammaire, ainsi que des microbiomes utérin et vaginal.
Et voici un fait fascinant : chez certaines femmes qui ont du mal à concevoir, le microbiome contient des bactéries qui, à vrai dire, tuent les spermatozoïdes. Or, il est possible de modifier ce microbiome. Nous avons eu quelques réussites incroyables où nous avons modifié le microbiome de femmes porteuses de ces bactéries tueuses de spermatozoïdes, et elles ont maintenant de beaux bébés.
C’est fou de penser qu’il existe des bactéries qui n’aiment tout simplement pas le sperme de votre mari !
Et voici un autre rappel amusant. Dans la plupart des cultures, les baisers font partie intégrante des interactions entre deux êtres, même s’ils le font de différentes manières. On suppose, et je pense que c’est plus qu’une simple supposition, que votre microbiome buccal vérifie essentiellement celui de votre partenaire potentiel pour s’assurer de sa compatibilité.
Propos initialement recueillis par Shawna Robins
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